Personal tools

MacroAPE 1083:MSX2 f1

From FANTOM5_SSTAR

Revision as of 13:47, 7 September 2012 by Autoedit (talk | contribs)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search

Full Name: MSX2_f1

Motif matrix
POACGT
10.00.00.897959183673469510.102040816326525
210.1020408163265250.00.89795918367346950.0
39.9897959183673420.01.01020408163265360.0
40.00.00.011.0
52.1326530612244880.00.08.867346938775512
62.0204081632653051.9081632653061223.9285714285714273.142857142857146
71.2627551020408171.3753.1709183673469395.191326530612244

Sample specificity

The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon


TomTom analysis

<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya


Target_ID

Optimal_offset

p-value

E-value

q-value

Overlap

Query
consensus
Target
consensus

Orientation

Prrx2#MA0075.105.04198e-050.02399980.04010715TAATTGTTAATT-
Dll#MA0187.100.0001154010.05493090.04010717TAATTGTTAATTAC+
YHP1#MA0426.100.0003060610.1456850.04010716TAATTGTTAATTG+
HAT5#MA0008.120.0003392330.1614750.04010716TAATTGTAATAATTG-
Nobox#MA0125.100.0004089120.1946420.04010717TAATTGTTAATTGGT+
PHDP#MA0457.110.000446350.2124620.04010716TAATTGTTTAATTA+
Dr#MA0188.100.0004842510.2305030.04010717TAATTGTTAATTGG-
unc-4#MA0250.110.0004842510.2305030.04010716TAATTGTTTAATTG+
CG13424#MA0175.110.0006112350.2909480.04010716TAATTGTTTAATTG+
CG32532#MA0179.110.0007086430.3373140.04010716TAATTGTTTAATTA+
hbn#MA0226.110.0007086430.3373140.04010716TAATTGTTTAATTA+
CG34031#MA0444.110.0007086430.3373140.04010716TAATTGTTTAATTG+
Hmx#MA0192.110.0007617050.3625710.04010716TAATTGTTTAATTG+
NK7.1#MA0196.110.0007617050.3625710.04010716TAATTGTTTAATTG+
CG11085#MA0171.110.0008786740.4182490.04010716TAATTGTTTAATTG+
Ubx#MA0094.200.0009345360.4448390.04010714TAATTGTTAAT+
OdsH#MA0455.110.0009434130.4490650.04010716TAATTGTCTAATTA+
en#MA0220.110.0009434130.4490650.04010716TAATTGTTTAATTA+
slou#MA0245.110.0009434130.4490650.04010716TAATTGTTTAATTA+
OdsH#MA0455.110.0009434130.4490650.04010716TAATTGTCTAATTA+
CG15696#MA0176.110.001013490.4824230.04103476TAATTGTTTAATTA+
Nkx2-5#MA0063.110.001085950.516910.04126576TAATTGTTTAATTG+
B-H2#MA0169.110.00116480.5544440.04126576TAATTGTTTAATTG+
Pph13#MA0200.110.00116480.5544440.04126576TAATTGTCTAATTA+
Rx#MA0202.110.001257450.5985470.04276626TAATTGTCTAATTA+
Pdx1#MA0132.110.001393490.66330.04352835TAATTGTCTAATT+
ATHB-5#MA0110.120.001531710.7290940.04352837TAATTGTAATAATTGG-
Vsx1#MA0181.110.001535830.7310540.04352836TAATTGTTTAATTA+
unpg#MA0251.110.001535830.7310540.04352836TAATTGTTTAATTA+
YOX1#MA0433.110.001720420.8189220.04718727TAATTGTTTAATTAA+
CG9876#MA0184.110.002144051.020570.05696866TAATTGTCTAATTA+
Lim3#MA0195.100.002479021.180020.06199437TAATTGTTAATTAA-
repo#MA0240.110.002479021.180020.06199436TAATTGTTTAATTA+
tup#MA0248.110.002655341.263940.06450636TAATTGTTTAATTG+
inv#MA0229.120.002885081.37330.06687566TAATTGTTCTAATTA+
lbl#MA0232.100.002910181.385240.06687566TAATTGTTAATTA+
otp#MA0236.110.003024411.439620.06767186TAATTGTTTAATTA+
CG32105#MA0178.110.003217521.531540.07014666TAATTGTTTAATTA+
bsh#MA0214.110.003417371.626670.07264116TAATTGTTTAATTG+
HGTX#MA0191.110.003626361.726150.07308266TAATTGTTTAATTA+
ro#MA0241.110.003626361.726150.07308266TAATTGTCTAATTA+
SMP1#MA0383.180.0036961.75930.07308267TAATTGTTGCTAATTTAATTATAGGTAA-
B-H1#MA0168.110.004071271.937920.07525276TAATTGTTTAATTG+
exex#MA0224.110.004071271.937920.07525276TAATTGTGTAATTA+
exex#MA0224.110.004071271.937920.07525276TAATTGTGTAATTA+
Awh#MA0167.110.004815272.292070.08188436TAATTGTTTAATTA+
C15#MA0170.110.004815272.292070.08188436TAATTGTTTAATTA+
Lhx3#MA0135.170.00493622.349630.08229486TAATTGTGATTAATTAATTT-
Ubx#MA0094.220.005092242.42390.08326366TAATTGTTTTAATTA+
CG18599#MA0177.100.005659342.693850.08592667TAATTGTTAATTAA-
Lim1#MA0194.110.005659342.693850.08592666TAATTGTTTAATTA+
ap#MA0209.110.005659342.693850.08592666TAATTGTCTAATTA+
Oct#MA0197.120.00600912.860330.08659796TAATTGTTTTAATTA+
E5#MA0189.110.006289292.99370.08766416TAATTGTTTAATTA+
Vsx2#MA0180.120.006402693.047680.08780527TAATTGTTTTAATTAG+
abd-A#MA0206.110.006629323.155560.08947026TAATTGTTTAATTA+
CG11294#MA0172.110.006981973.323420.09133026TAATTGTTTAATTA+
al#MA0208.110.006981973.323420.09133026TAATTGTTTAATTA-
zen2#MA0257.110.007350963.499060.09421116TAATTGTTTAATTA+
CG7056#MA0183.100.00742463.534110.09421117TAATTGTTAATTAAA-
MATALPHA2#MA0328.140.007534613.586480.09421115TAATTGTCATGTAATT+
HNF1A#MA0046.130.00810013.855650.09542527TAATTGTGGTTAATAATTAAC+
SUM1#MA0398.120.008369523.983890.09542527TAATTGTAAAAATTTT-
ind#MA0228.110.008978484.273760.09542526TAATTGTCTAATTA+
CG4328#MA0182.110.009427914.487680.09775786TAATTGTTTTATTA+
ftz#MA0225.110.00989634.710640.09899296TAATTGTTTAATGA+
ems#MA0219.110.01038334.942450.1014776TAATTGTTTAATGA+
PHO2#MA0356.110.01110335.285150.1037825TAATTGTATAATA+
lab#MA0230.110.01141485.433430.1037826TAATTGTTTAATTA+
pb#MA0238.100.01141485.433430.1037827TAATTGTTAATTAA-
HOXA5#MA0158.130.01222595.819530.1050015TAATTGTCACTAATT+
H2.0#MA0448.110.01253135.964910.1054936TAATTGTTTAATTA+
eve#MA0221.110.01437976.844750.1163556TAATTGTCTAATGA+
lbe#MA0231.100.01450576.904730.1163556TAATTGTTAACTA+