MacroAPE 1083:7-AGTCATATGAC
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: 7-AGTCATATGAC,CNhs13472,BestGuess:TFEB.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.705287273320293),T:704.0(16.17%),B:4284.1(9.54%),P:1e-42
Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GCN4#MA0303.1 | 9 | 0.00299306 | 1.4247 | 1 | 11 | AGTCATATGAC | CAAGGGATGAGTCATACTTCA | + |
NFE2L1::MafG#MA0089.1 | -5 | 0.00510652 | 2.4307 | 1 | 6 | AGTCATATGAC | CATGAC | + |
BAS1#MA0278.1 | 10 | 0.00838853 | 3.99294 | 1 | 11 | AGTCATATGAC | GCACAGCCAGAGTCAAGTCAA | + |