MacroAPE 1083:CNhs11990 bl f1
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: CNhs11990_bl_f1
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SPT23#MA0388.1 | 0 | 0.000309994 | 0.147557 | 0.295115 | 8 | TTAATTTCTTAA | TTGATTTC | - |
| br_Z1#MA0010.1 | -2 | 0.00298285 | 1.41984 | 1 | 10 | TTAATTTCTTAA | GATTTGTCTATTAC | - |
| SUM1#MA0398.1 | 0 | 0.00429915 | 2.0464 | 1 | 9 | TTAATTTCTTAA | AAAATTTTT | + |
| PEND#MA0127.1 | -3 | 0.00866562 | 4.12484 | 1 | 9 | TTAATTTCTTAA | ACTTCTTATT | + |
| HMG-I/Y#MA0045.1 | 5 | 0.011736 | 5.58632 | 1 | 11 | TTAATTTCTTAA | GTTTTTCCATTTGTTG | - |
| br_Z4#MA0013.1 | -1 | 0.016486 | 7.84733 | 1 | 11 | TTAATTTCTTAA | TTTGTTTACTA | - |
| fkh#MA0446.1 | -1 | 0.0173864 | 8.27592 | 1 | 11 | TTAATTTCTTAA | TGTTTGCTTAA | + |
| AZF1#MA0277.1 | 0 | 0.0181688 | 8.64833 | 1 | 9 | TTAATTTCTTAA | TTTCTTTTT | - |
| tll#MA0459.1 | 1 | 0.0190617 | 9.07336 | 1 | 9 | TTAATTTCTTAA | TTTGACTTTT | - |
