MacroAPE 1083:VDR f2
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: VDR_f2
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RXRA::VDR#MA0074.1 | 0 | 6.70506e-16 | 3.19161e-13 | 6.36138e-13 | 15 | GGGTCAACGAGTTCAC | GGGTCAACGAGTTCA | + |
| usp#MA0016.1 | 1 | 0.000250344 | 0.119164 | 0.118756 | 9 | GGGTCAACGAGTTCAC | GGGGTCACGG | + |
| RXR::RAR_DR5#MA0159.1 | 0 | 0.000405652 | 0.193091 | 0.128287 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | AGGTCATGGAGAGGTCA | + |
| ESR2#MA0258.1 | 2 | 0.000598305 | 0.284793 | 0.141909 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | CAAGGTCACGGTGACCTG | + |
| RORA_1#MA0071.1 | -5 | 0.00104595 | 0.497872 | 0.198468 | 10 | GGGTCAACGAGTTCAC | ATCAAGGTCA | + |
| ESR1#MA0112.2 | 2 | 0.00281905 | 1.34187 | 0.40991 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | CCAGGTCACCGTGACCCC | + |
| Ar#MA0007.1 | 4 | 0.00302439 | 1.43961 | 0.40991 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | GGCGGGTACACGATGTTCTTAT | - |
| NR4A2#MA0160.1 | 1 | 0.00497384 | 2.36755 | 0.589862 | 7 | GGGTCAACGAGTTCAC | AAGGTCAC | + |
| NFE2L1::MafG#MA0089.1 | -2 | 0.00715796 | 3.40719 | 0.619511 | 6 | GGGTCAACGAGTTCAC | GTCATG | - |
| ESR1#MA0112.2 | 0 | 0.00722936 | 3.44117 | 0.619511 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | AGGTCAGGGTGACCTGGGCC | - |
| GAL4#MA0299.1 | 1 | 0.00762702 | 3.63046 | 0.619511 | 14 | GGGTCAACGAGTTCAC | CGGGGAACAGTACTC | + |
| CREB1#MA0018.1 | 1 | 0.00804545 | 3.82963 | 0.619511 | 11 | GGGTCAACGAGTTCAC | GACGTCACCAGG | - |
| NR3C1#MA0113.1 | 2 | 0.00914172 | 4.35146 | 0.619511 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | TCAGGACATAATGTTCCC | - |
| Pax2#MA0067.1 | -1 | 0.0102351 | 4.87192 | 0.627819 | 8 | GGGTCAACGAGTTCAC | AGTCACGG | + |
| RORA_2#MA0072.1 | -2 | 0.0105878 | 5.03979 | 0.627819 | 14 | GGGTCAACGAGTTCAC | TATAAGTAGGTCAA | + |
| PPARG#MA0066.1 | 2 | 0.0114707 | 5.46006 | 0.640163 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | GTAGGTCACGGTGACCTACT | + |
| Pax4#MA0068.1 | 4 | 0.0200645 | 9.55073 | 0.933614 | 16 | GGGTCAACGAGTTCAC | GGGGGGGGAGTGGAGTATTGGAAATTTTTC | - |
| ct#MA0218.1 | -1 | 0.0209774 | 9.98526 | 0.933614 | 6 | GGGTCAACGAGTTCAC | GTTCAA | - |
