Personal tools

MacroAPE 1083:ISL1 f1

From FANTOM5_SSTAR

Revision as of 14:58, 7 September 2012 by Autoedit (talk | contribs)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search

Full Name: ISL1_f1

Motif matrix
POACGT
10.370614035087719845.61622807017543756.6425438596491250.37061403508771984
20.04.6754385964912342.2807017543859646.043859649122802
31.1403508771929820.00.011.859649122807019
413.00.00.00.0
513.00.00.00.0
60.00.00.013.0
75.3596491228070180.07.6403508771929820.0

Sample specificity

The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon


TomTom analysis

<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya


Target_ID

Optimal_offset

p-value

E-value

q-value

Overlap

Query
consensus
Target
consensus

Orientation

Dfd#MA0186.1-10.000227170.1081330.1338716GTTAATGTTAATGA+
Scr#MA0203.1-10.0004315270.2054070.1338716GTTAATGTTAATGA+
zen#MA0256.1-10.0007586850.3611340.1338716GTTAATGCTAATGA+
HNF1B#MA0153.1-10.0008261010.3932240.1338716GTTAATGTTAATATTTAAC+
Ubx#MA0094.2-20.0009029990.4298280.1338714GTTAATGTAAT+
E5#MA0189.1-10.001166460.5552340.1338716GTTAATGTTAATTA+
ems#MA0219.1-10.001166460.5552340.1338716GTTAATGTTAATGA+
eve#MA0221.1-10.001166460.5552340.1338716GTTAATGCTAATGA+
btn#MA0215.1-10.001425460.6785180.1454186GTTAATGTTAATGA+
pb#MA0238.1-10.002253791.072810.1765726GTTAATGTTAATTA+
Antp#MA0166.1-10.002462121.171970.1765726GTTAATGTTAATGA+
bsh#MA0214.1-10.002462121.171970.1765726GTTAATGTTAATTG+
HNF1A#MA0046.110.002500111.190050.1765727GTTAATGGGTTAATAATTAAC+
ftz#MA0225.1-10.002922671.391190.1788946GTTAATGTTAATGA+
zen2#MA0257.1-10.002922671.391190.1788946GTTAATGTTAATTA+
tup#MA0248.1-10.003214231.529970.1844446GTTAATGTTAATTG+
ind#MA0228.1-10.004105131.954040.2217096GTTAATGCTAATTA+
Pdx1#MA0132.1-10.004940952.351890.2398676GTTAATGCTAATT+
CG13424#MA0175.1-10.005486352.61150.2398676GTTAATGTTAATTG+
CG18599#MA0177.1-10.005486352.61150.2398676GTTAATGCTAATTA+
lab#MA0230.1-10.005486352.61150.2398676GTTAATGTTAATTA+
slou#MA0245.1-10.006271492.985230.2527116GTTAATGTTAATTA+
Oct#MA0197.100.006330613.013370.2527117GTTAATGTTTAATTA+
ap#MA0209.1-10.006691323.185070.2555396GTTAATGCTAATTA+
HGTX#MA0191.1-10.007591173.61340.2555396GTTAATGTTAATTA+
CG11085#MA0171.1-10.008071393.841980.2555396GTTAATGTTAATTG+
NK7.1#MA0196.1-10.008071393.841980.2555396GTTAATGTTAATTG+
abd-A#MA0206.1-10.008071393.841980.2555396GTTAATGTTAATTA+
H2.0#MA0448.1-10.008071393.841980.2555396GTTAATGTTAATTA+
Vsx1#MA0181.1-10.009107774.33530.2697476GTTAATGTTAATTA+
otp#MA0236.1-10.009107774.33530.2697476GTTAATGTTAATTA+
Lim3#MA0195.1-10.00966734.601640.2773716GTTAATGTTAATTA+
Awh#MA0167.1-10.01228385.847110.3417646GTTAATGTTAATTA+
lbl#MA0232.1-20.01437616.843010.3535165GTTAATGTAATTA+
C15#MA0170.1-10.01452366.913220.3535166GTTAATGTTAATTA+
unpg#MA0251.1-10.01452366.913220.3535166GTTAATGTTAATTA+
en#MA0220.1-10.0153327.298020.3535166GTTAATGTTAATTA+
ro#MA0241.1-10.0153327.298020.3535166GTTAATGCTAATTA+
HOXA5#MA0158.110.01579017.51610.3535167GTTAATGCACTAATT+
CG32532#MA0179.1-10.01617167.697670.3535166GTTAATGTTAATTA+
CG34031#MA0444.1-10.01617167.697670.3535166GTTAATGTTAATTG+
Ubx#MA0094.200.01860758.857170.3973077GTTAATGTTTAATTA+
SKO1#MA0382.110.02068639.846680.4092257GTTAATGACGTAATG+
CG9876#MA0184.1-10.02094859.971490.4092256GTTAATGCTAATTA+
unc-4#MA0250.1-10.02094859.971490.4092256GTTAATGTTAATTG+
PHDP#MA0457.1-10.02094859.971490.4092256GTTAATGTTAATTA+